Atlas français des champignons du sol

Les chercheurs spécialistes de l’écologie microbienne de l’unité mixte de recherche « Agroécologie », rattachée à l’INRAE Bourgogne Franche-Comté, ont inventorié les champignons des sols grâce aux techniques de séquençage génétique. Ils présentent la composition, l’organisation et la répartition des réseaux mycéliens des sols, et nous ouvrent une fenêtre sur un monde méconnu et fascinant.

Venant compléter l’atlas Français des bactéries du sol, cet ouvrage constitue une avancée dans la connaissance des sols et de leur fonctionnement. Il participe à une dynamique générale qui vise à relever le défi de la conservation des sols au cours des prochaines décennies.

Les auteurs

Christophe DJEMIEL (photo)
Jeune chercheur depuis 6 ans à INRAE de Dijon et titulaire d’un doctorat en écologie microbienne, Christophe et auteur de plus d’une vingtaine d’articles scientifiques. Il a assuré la coordination de la réalisation de l’ouvrage. Grâce à sa forte expérience en bio-informatique, et statistiques dans les big data, il s’intéresse à la biogéographie et au rôle fonctionnel des champignons du sol. Il raffole des cèpes de Bordeaux !

Sébastien TERRAT (photo)
Maître de conférences à l’Université de Bourgogne et titulaire d'un doctorat en écologie microbienne, son expertise en bio-informatique lui permet d’analyser les données issues de séquençages génétiques. Sébastien est impliqué dans les projets sur la distribution spatiale des micro-organismes qui ont mené à la rédaction de l’Atlas français des bactéries du sol et à l’Atlas sur les champignons des sols français en 2024. Ses travaux de recherche visent à mieux comprendre l’importance de la diversité des communautés microbiennes comme facteur déterminant dans le fonctionnement du sol et ses services associés.

Samuel DEQUIEDT (photo)
Ingénieur d’Études à INRAE, Samuel est expert en traitement des données en écologie microbienne des sols. Il est notamment impliqué dans les projets emblématiques à l’échelle nationale à la base de l’Atlas français des bactéries du sol ainsi que celui des champignons. Il est également impliqué dans le développement et le transfert d’outils de diagnostic des sols (caractérisation microbiologique) pour répondre aux défis du monde agricole et aux questionnements sociétaux dans le cadre de la transition Agro-écologique.

Pierre-Alain MARON (photo)
Directeur de recherche à INRAE de Dijon, Pierre-Alain est spécialiste de l'écologie microbienne du sol. Ses travaux portent sur le rôle de la diversité des communautés microbiennes dans le fonctionnement du sol. Son expertise est reconnue au niveau national et international. Il a à cœur de sensibiliser les agriculteurs, les citoyens et les pouvoirs publics à l'importance de la biodiversité des sols pour des usages plus durables en milieu agricole et urbain.

Claudy JOLIVET (photo)
Pédologue à INRAE, spécialiste des sols et des champignons, Claudy coordonne le Réseau de mesures de la qualité des sols (RMQS). Depuis plus de 20 ans, ce réseau national vise à mieux connaître le fonctionnement des sols : carbone, eau et changement climatique, contamination et santé, biodiversité. Le RMQS est à l’origine des données de cet Atlas. Mycologue passionné, il réalise à titre personnel des inventaires, des conférences et des animations sur les champignons et il est engagé dans plusieurs actions nationales pour leur protection.

Lionel RANJARD (photo)
Directeur de recherche à INRAE de Dijon, Lionel est expert en écologie microbienne des sols. Il a coordonné l’ensemble des études scientifiques qui ont mené à l’élaboration de l’Atlas français des bactéries du sol en 2018 et au présent atlas sur les champignons des sols français en 2024. Il est fortement impliqué dans les applications possibles de ces indicateurs de l’activité microbiologique des sols auprès des agriculteurs, du monde socio-économique et des politiques publiques.